产品应用案例│东纳MagBeadsTM羧基磁珠和硅羟基磁珠在核酸提取及片段筛选中的应用
硅羟基磁珠和羧基磁珠被广泛地应用于核酸提取及片段筛选中。磁珠的尺寸、表面修饰及均一性均会影响核酸提取的纯度、质量及收率。硅羟基提取核酸通常是通过在高浓度盐环境下屏蔽溶液中的静电斥力,破坏磁珠和核酸分子表面原有的水化层,促使核酸在磁珠表面的吸附。而羧基磁珠除了可以用于高浓度盐环境下的核酸提取,更被广泛地应用于片段筛选中。在片段筛选中,通过调控溶液中加入的PEG和盐的量,使得核酸的分子构象由伸展的状态逐渐蜷缩成小球状,同时消除了表面的负电荷,促进核酸分子在磁珠上的吸附。这种构象的变化与核酸的分子量密切相关(分子量越大,越倾向于发生构象变化)。通过调节盐溶液与核酸样本的体积比,便能实现片段筛选。南京东纳生物有限公司具有各种尺度、各种表面修饰的磁珠,被广泛地应用于分子诊断中。
图1:东纳MagBeadsTM羧基磁珠和硅羟基磁珠电镜图
核酸提取案例
采用1 mm硅羟基磁珠和200 nm硅羟基磁珠配合不同公司的血液DNA提取试剂盒、植物基因组DNA提取试剂盒、病毒核酸提取试剂盒,结果显示1 mm硅羟基磁珠和200 nm硅羟基磁珠分别在不同的项目中体现出优势。
核酸提取案例一:磁珠法血液基因组DNA提取
图2:使用T公司血液提取试剂盒,分别搭配T公司磁珠、东纳200 nm和东纳1 μm磁珠提取200 μL血液,100 μL洗脱DNA,取2 μL进行电泳,取2 μL进行NanoDrop One测量浓度及纯度。结果显示东纳1 mm磁珠提取得率明显高于T公司,M:Marker D15000
核酸提取案例二:磁珠法植物基因组DNA提取
图3:使用T公司植物基因组DNA提取试剂盒,分别搭配T公司磁珠、东纳200 nm和东纳300 nm磁珠提取100 mg植物,100 μL洗脱DNA,取6 μL进行电泳,取2 μL进行NanoDrop One测量浓度及纯度。结果显示东纳200 nm磁珠和300 nm磁珠的提取得率和纯度都明显高于T公司,M:Marker D15000
核酸提取案例三:磁珠法病毒核酸提取
图4:使用K公司病毒核酸提取试剂盒,分别搭配K公司磁珠、东纳200 nm和东纳1 mm磁珠,结果显示东纳1 mm磁珠提取得率明显高于K公司
片段筛选案例
采用200 nm羧基磁珠配合DNA片段筛选试剂形成核酸纯化/分选试剂盒,适用于PCR产物纯化以及高通量测序文库构建中DNA片段大小快速分选和回收,具有高的DNA吸附量。
图5:200 nm羧基磁珠配合DNA片段筛选试剂形成的核酸纯化/分选试剂盒与市面上同类产品比较DNA片段纯化得率高,100 bp以上片段回收效率可达85%以上
相关产品信息
产品名称 | 货号 | 规格 | 表面基团 |
MagBeadsTM 1 μm 羧基磁珠 | MB1001 | 10 mg/mL | 羧基(-COOH) |
MagBeadsTM 1 μm 硅羟基磁珠 | MB1101 | 30 mg/mL | 羟基(-OH) |
200 nm羧基磁珠 | Mag9100 | 10 mg/mL | 羧基(-COOH) |
200 nm硅羟基磁珠 | Mag9210 | 30 mg/mL | 羟基(-OH) |
300 nm羧基磁珠 | Mag9200 | 10 mg/mL | 羧基(-COOH) |
300 nm硅羟基磁珠 | Mag9310 | 30 mg/mL | 羟基(-OH) |
东纳生物MagBeads™磁珠在免疫诊断、化学发光、分子诊断、蛋白纯化、细胞分选等方面都有很好的应用,是科研探索、工业应用的重要基石。
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