东纳生物推出MagBeads®刀豆蛋白A磁珠
刀豆蛋白A(Concanavalin A,缩写ConA)是一种糖类结合蛋白,又叫刀豆球蛋白A、伴刀豆球蛋白、刀豆素、刀豆凝集素,在Ca2+和 Mn2+存在的情况下可与糖蛋白、糖脂、多糖中的α-D-葡萄糖或α-D-甘露糖结合。
东纳生物提供的MagBeads®刀豆蛋白A磁珠是由ConA与1 μm磁性微球共价偶联而成,具有超顺磁性、磁响应速度快、单分散性好、快速高效特异性地结合糖蛋白或糖脂等特点,可用于纯化糖蛋白、分离细胞或细胞核等。MagBeads®刀豆蛋白A磁珠分离或固定细胞后可直接用于染色质分析实验如核酸酶靶向切割和释放(CUT & RUN)、靶向剪切及转座酶技术(CUT & Tag)中细胞的捕获和固定,与目前广泛使用的染色质免疫沉淀(ChIP)法相比,更简单易用,省时省力。
图1. MagBeads®刀豆蛋白A磁珠的扫描电镜图(A)和示意图(B)
| MagBeads®刀豆蛋白A磁珠 |
货号 | MB1205 |
浓度 | 10 mg/mL |
粒径 | 约1.0 μm |
表面电位 | 约-20 mV |
ConA载量 | 90 μg / 1 mg 磁珠 |
保存条件 | 密封,4℃/24个月,禁止冷冻,使用前请充分混匀 |
包装 | PP瓶 |
蛋白质糖基化是目前在高等真核生物中发现的最普遍、最重要的蛋白质翻译后修饰方式之一,该类修饰涉及聚糖与蛋白质分子的连接,是蛋白质分子正确折叠、维持稳定、参与细胞黏附等活动所必需的。糖基化肽和蛋白的分离、发现和鉴定在糖蛋白组学和诊断中变得越来越重要。
Sparbier等人[1]利用刀豆蛋白A磁珠(ConA磁珠)建立了糖基化蛋白质的分离和检测方案。研究采用非糖基化蛋白牛血清白蛋白(BSA)作为阴性对照,将牛乳铁蛋白(Lactoferrin)、卵清蛋白(Ovalbumin)、牛RNase B和牛转铁蛋白(Transferrin)作为糖基化模型蛋白,并利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionzation Time of Flight Mass Spectrometry,MALDI-TOF-MS)(A)和聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)(B)分析了ConA磁珠结合各蛋白后的上清液和洗脱液,结果显示ConA磁珠不结合非糖基化蛋白BSA,而对牛乳铁蛋白的结合率最高,其次是牛转铁蛋白、卵清蛋白和牛RNase B。
图2.采用MALDI-TOF-MS (A)和SDS-PAGE (B)分析ConA磁珠结合各蛋白后的上清液和洗脱液
Skene等人[2]提出了一种改进的CUT&RUN方案,该方案采用刀豆蛋白A磁珠固定细胞而无需分离细胞核,从细胞到纯化的DNA,只需不到一天的时间,极大的缩短了实验周期。并且该方案可在仅用100个细胞进行组蛋白修饰和1000个细胞进行转录因子修饰时提供高质量的实验数据。
研究采用ConA磁珠捕获细胞,利用去垢剂洋地黄皂苷通透细胞膜,并与抗体共孵育使其结合到细胞中的靶蛋白上,随后加入蛋白A-微球菌核酸酶(pA-MN),在0°C下进行Ca2+依赖性消化反应,使其特性切割靶蛋白两侧的DNA,切割释放的碎片自由扩散出核。离心除去完整细胞核后,含有染色质片段的上清液可直接提取DNA进行后续实验。
图3.刀豆蛋白A磁珠捕获细胞后用于CUT&RUN实验
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参考文献:
[1] Sparbier K, Koch S, Kessler I, Wenzel T, Kostrzewa M. Selective isolation of glycoproteins and glycopeptides for MALDI-TOF MS detection supported by magnetic particles. J Biomol Tech. 2005;16(4):407-413.
[2] Skene PJ, Henikoff JG, Henikoff S. Targeted in situ genome-wide profiling with high efficiency for low cell numbers. Nat Protoc. 2018;13(5):1006-1019. doi:10.1038/nprot.2018.015
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